学校医院于2004年由原九江师专、九江医专、九江财专医院（所、室）合并组建而成，2006年5月份由附属医院托管，现为中国高等教育学会保健医学分会理事单位、江西省高等教育保健医学会和庐山区药学会常务理事单位。

校医院现有在编职工33人，卫技人员30人，其中副高3人，中级20人；医院设有内科、外科、骨伤科、口腔科、耳鼻咽喉科、妇科、预防保健科、B超、心电图、检验科、放射科等业务科室，还配有抢救室、手术室、注射室、换药室、理疗室。可开设病床30余张，拥有X光机、彩色超声机、黑白B超、心电监护仪、心电图机、乳腺红外诊断仪、乳腺微波治疗仪、CO 2激光治疗仪，血球分析仪、电解质仪、全自动生化分析仪等医疗设备。

医院承担着全校师生员工的基本医疗服务、健康体检、健康教育、医疗保险、传染病防治以及校园内公共医疗卫生突发事件的应急处理等工作。在学校各级党政组织正确领导下，将不断加强医院管理，提高医疗质量，改善就医环境，狠抓学科建设和医德医风建设，努力提高医院的整体医疗水平和服务质量，为全校师生的健康保驾护航。